Deteksi keturunan kelapa sawit (Elaeis guineensis) rendah asam lemak bebas menggunakan marka Simple Sequence Repeat (SSR)

Abstract

Abstrak. Arifiyanto D, Basyuni M, Damanik RIM, Rosmayati, Astari RP. 2024. Deteksi keturunan kelapa sawit (Elaeis guineensis) rendah asam lemak bebas menggunakan marka Simple Sequence Repeat (SSR). Pros Sem Nas Masy Biodiv Indon 10: 89-93. Program seleksi kelapa sawit memerlukan benih yang bermutu dan murni untuk mendapatkan hasil yang berkualitas. Salah satu cara yang dapat dilakukan adalah dengan menganalisis kemurnian keturunan yang diperoleh. Keturunan yang murni adalah yang memiliki alel dari kedua induknya tanpa adanya penyimpangan. Sidik jari DNA dapat memberikan informasi mengenai kemurnian keturunan tersebut.  Simple Sequence Repeat (SSR) adalah salah satu metode sidik jari DNA yang memiliki keunggulan dalam efisiensi. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi kemurnian individu keturunan kelapa sawit unggul yang memiliki sifat rendah asam lemak bebas. Hasil kuantitas dan kualitas DNA yang dipergunakan memiliki tingkat kemurnian yang baik yaitu antara 1,8-2,2 dan kuantitas yang cukup banyak >100 ng/µL, sehingga dapat dipergunakan untuk proses lanjutan. Hasil visualisasi alel-alel SSR menggunakan gel poliakrilamid, dikuantifikasikan dan dianalisis sesuai hukum segregasi Mendel, menggunakan Software Uvitech 1D. Berdasarkan hasil analisis pada persilangan SL81 terdapat satu dari lima individu yang menunjukkan ketidakmurnian dengan nilai probabilitas adalah 0,5, ditemukan oleh marka mEgCIR3543. Sedangkan pada SL33, keseluruhan keturunannya adalah murni ditunjukkan dengan nilai probabilitas kemurnian adalah 1. Ketiga marka SSR pada penelitian ini dapat digunakan untuk melakukan identifikasi kermunian keturunan pada kelapa sawit, mempercepat proses seleksi dan menghemat biaya dan luasan lokasi.